为什么会有第二次冲击？
这是一个黑暗的时代，毁灭的时代，死亡的时代，但是，既然活下来，就去面对吧。
因为别无选择。
为什么会有第二次冲击？
他感到疑惑，即使后来被远亲收养，进入大学，这种疑惑依然挥之不去……直到，他加入了NERV……
2005年美里和律子在长野县第2新东京市的第2东京大学内相识，之后加持良治和美里相识。
没有多久，加持和美里开始同居。
第3新东京市开始建设。
2007年美里和加持分手。
2015年使徒来袭。
从第二次浩后经过了15年，人类总算能重新繁荣来。
EVA已有3台可以实际使用了，而后三位14岁的少男少女——碇真嗣，绫波丽和惣流?明日香?兰格丽，可以担任EVA的驾驶员，人们不得不把未来的希望寄望在他们身上。
面对重现的使徒们，肩上背负着人类存亡如此重大命运的少年们的战争现在开始了。
这一年，加持良治NERV和SEELE的双面间谍身份暴露，死亡。
一个月后，渚薰以第五适格者的身份加入NERV。
不久，渚薰死亡。
他的真面貌是第十七使徒，“对我来说生存和死亡对是一样的，死亡对我而言是唯一的自由。”
你们需要未来。
谢谢你。
能够认识你，我很高兴。
——这是渚薰最后的话，他死于碇真嗣之手。
对于2000年的，加持和渚薰第一次也是最后一次相遇，两位当事人都没有半点的印象。
魂之轮回:
新剧场版主题曲
12年的EVA，永难忘怀:
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蜂蜜与四叶草
蜂蜜与四叶草滨美大校园内，一个英俊的青年撑着一把开满绿色四叶草的阳伞，伞下是一个约摸15，16岁的女孩，青年眼神温柔的看着身边的女孩，他们走过教学楼，走过操场——女孩停了下来，“他们还没入学呢。
连那个著名的摩天轮也没有建成。”
他们来到空无一人的陶艺室，女孩的手轻轻拂过这些陶艺品，脸上带着些许的怀念，“如果把他们都垒在一起，也许我也能造出一座青春之塔。”
在草地上，女孩低头寻找着什么，终于一声叹息，“果然是传说中的四叶草，不可能那么容易找到。”
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