托勒密十三世·西奥斯·菲洛帕托尔（pto1eyxiiitheosphi1opator），大约公元前62年出生，公元前47年1月13日去世。
他是公元前51年至公元前47年间的埃及法老，是托勒密王朝（公元前3o5年至公元前3o年）最后的成员之一。
他是托勒密十二世·奥莱特（pto1eyxiiau1etes）的儿子，与克利奥帕特拉七世（c1eopatravii）同为共同统治者。
克利奥帕特拉离开埃及时，引了法老之间的内战。
托勒密十三世之后与他的另一位妹妹，阿尔西诺四世（arsoeiv）共同统治。
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托勒密十三世·西奥斯·菲洛帕托尔是埃及法老托勒密十二世·奥莱特（pto1eyxiiau1etes）的儿子，他于公元前51年春继承父亲的王位，成为托勒密王国的法老，年仅11岁。
托勒密十二世在遗嘱中规定，托勒密十三世将与他的姐姐克利奥帕特拉七世（c1eopatravii）结婚，并共同执政。
公元前5o年1o月，托勒密十三世与克利奥帕特拉七世一同被提升为高级统治者，尽管宦官波西努斯（poth）充当了托勒密十三世的摄政。
公元前48年春，托勒密十三世和波西努斯试图废除克利奥帕特拉七世，因为她作为女王的地位日益上升。
这时期，克利奥帕特拉的面容出现在了铸造的硬币上，而托勒密十三世的名字则在官方文件中被省略。
托勒密十三世打算成为主要的统治者，波西努斯则作为幕后操控者。
托勒密十三世·西奥斯·菲洛帕托尔和波西努斯设法迫使克利奥帕特拉七世（c1eopatravii）逃往叙利亚，但她很快组织了自己的军队，并在埃及爆了内战。
与此同时，她的另一位姐姐阿尔西诺四世（arsoeiv）也开始宣称自己为埃及女王（公元前48–47年在位），进一步复杂化了局势。
此时，战败的罗马将军庞培（popey）来到埃及，寻求躲避追击他的竞争对手盖乌斯·尤利乌斯·恺撒（gaiju1icaesar）。
最初，托勒密十三世假装接受了庞培的请求，但在公元前48年9月29日，他指使阿基拉斯（achi11as）和卢修斯·塞普提米乌斯（ciseptii）谋杀了庞培，希望在恺撒到达时能够博得他的青睐。
当恺撒到达埃及时，庞培的头颅被呈上。
据说，恺撒没有感到高兴，反而表现出厌恶，并命令寻找庞培的遗体，给予他一个正规的罗马葬礼。
克利奥帕特拉七世成功赢得了恺撒的青睐，并成为他的情妇。
恺撒安排处决了波西努斯，并将克利奥帕特拉七世重新立为埃及女王，尽管她从未正式放弃与托勒密十三世的婚姻。
尽管如此，托勒密十三世仍然决心废除克利奥帕特拉七世，他与阿尔西诺伊四世结盟，共同组织了忠于他们的军队，与忠于克利奥帕特拉七世的军队，以及那部分随恺撒到来的相对较小的军队作战。
公元前48年12月中旬，双方在亚历山大城内生了战斗。
公元前47年，亚历山大围城战开始，该城遭受了严重破坏。
大约在这个时期，亚历山大图书馆被焚毁。
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